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Cuando estamos navegando por el sistema de ficheros a menudo necesitamos abrir ficheros o directorios como root. Eso es posible hacerlo sin tener que abrir un terminal y usando el botón derecho.
Abres un terminal normal de usuario común y corriente (NO de root) y escribes (copiar y pegar):

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gedit  $HOME/.gnome2/nautilus-scripts/Abrir\ como\ root

luego al archivo que se abre le colocas lo siguiente (copiar y pegar):

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#!/bin/bash
for uri in $NAUTILUS_SCRIPT_SELECTED_URIS; do
 gksudo "gnome-open $uri"
done

Guardas y cierras ese archivo.
Escribes en un terminal:

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chmod +x  $HOME/.gnome2/nautilus-scripts/Abrir\ como\ root

Reinicias Nautilus

Ahora abre una ventana de nautilus navega por cualquier directorio y en el menú que sale en el botón derecho aparecerá una opción Scripts->Abrir como root. Clica cuando tengas seleccionado un directorio o fichero y todo lo que abras lo estarás haciendo como root.